1、草菇菌丝为透明状，银灰色，分布均匀，菌丝较为稀疏，有红褐色的厚垣孢子为正常的菌种。草菇母种、原种、栽培种如厚垣孢子较多，一般来说，出菇后子实体较小；反之，子实体则较大。
　　2、若银灰色草菇菌丝间掺杂有洁白线状菌丝，随后出现鱼卵状颗粒，久之成黄棕色，则可能混有小菌核杂菌；若瓶内菌丝过分浓密、洁白，也可能是混有杂菌，都应淘汰。
　　3、如果菌瓶内菌丝逐渐消失，出现螨食斑块，说明染有螨虫，应淘汰。
　　4、瓶内菌丝已萎缩，出现水渍状液体，有腥臭味者不能使用。
　　5、草菇栽培种