食用菌栽培生产中，大部分害虫是以卵的形式进入基料的，其中小部分是产卵于基料内，然后播种，而大多则是播种后产卵的。通过菌种带幼虫活体（或活虫）进入播种阶段的概率较小。卵的孵化与基料发菌同步进行，一般情况下肉眼根本无法发现或鉴别；起初幼虫个体群体均较小，取食菌丝量很小，不容易引起注意，待幼虫不断发育长大，并随着群体的扩大，对菌丝危害较重时，已至第1潮出菇或进入出菇盛期，该阶段尚难察觉，直至第二潮菇发生困难，甚至不再出菇，基料表面菌丝消失殆尽、变为褐色时，才发现原来是害虫作祟。可以说，相当一部分生产者是该阶段发现害虫的。秋冬季节害虫的另一特点就是随着气温的逐渐降低，虫类亦在寻找温暖的庇护所，基料内比较适合，培养室、栽培棚内温度也较合适，在找到适当的“住处”之后，迅速繁殖，使害虫群体急速扩大。
食用菌上发生的害虫，前期发菌阶段均以咬食菌丝体为生，后期出菇阶段则连子实体一并“通吃”，发生严重时，基料表面由白变黄、变褐，甚至成为黑色，表层甚至内部密布害虫排泄物，子实体基部直至整个菌柄被咬食为海绵状，甚至菌盖上也有虫孔。
另一方面，虫害可导致某些病害或杂菌的肆虐。如基料表层菌丝消失、虫类排泄物遍布。引起腐烂后，诸如木霉、根霉等杂菌趁机而入，易产生病害；虫类咬食子实体导致幼菇（菇蕾）死亡、腐烂，还易吸引外界成虫进入，虫体上带有若干细菌或真菌，在增加害虫（虫口）密度的同时，又带入了大量的病菌，给本来已经受损的食用菌生产“雪上加霜”。