1.点状污染型;手摸菌袋微有发热，袋内散布看见形状不规则的浅绿色霉点，是灭菌不彻底造成的，灭菌过程中漏气严重、灭菌温度未达到100℃、灭菌时间过短，锅内料袋排放过紧、过密，使袋内受热不均匀等，均会引起这种杂菌。
2.种穴连续污染型;连续数袋接种穴均出现色斑，是选用了污染的原种所致，如再扩接，将造成连续污染。
3.孔穴偶尔发现污染型;个别孔穴出现污染，是接种前接种箱（室）消毒不彻底，胶布未贴紧或菌种接种时，接种口有空隙造成。
4.种穴根霉污染型;如接种穴污染大多数是根霉或链孢霉，可能是接种箱（室）湿、温度高，防治可放置吸湿剂（如石灰、木炭等）吸湿及降温等措施。
5.端头污染型;菌袋两端或一端污染，是因袋口未系紧，密封不好，或木屑过粗，装袋时挤压，颗粒棱角刺破薄膜造成污染。
6.非接种穴出现零星污染型;制作菌袋搬运中被硬东西刺碰所引起。
7.烧菌型;由于气温过高，气温超过30℃，菌丝发黄，不再蔓延。