1、打孔的时机选择的不合理，打孔时即使在一个季节或月份，也要选择气温相对低的几天进行。气温在28℃以上，尤其超过30℃的天气，是不能进行打孔作业的。
2、打孔的排放方式和对温度控制不够
(1)、打孔的摆放方式存在失误，应根据当地的季节和气温条件合理设计行距、垛距、层数和摆放的方式。如果这方面做的不够就会造成烧菌。即根据季节、当时的温度和未来5–10天的气温条件进行合理设计。采用一层三袋的方式，最多摆放5-6层，气温较高的月份天气，放大气后直接摆成“井字”形4-7层，或“三角形”堆，摆放4-6层。然后根据气温的不断变化，再灵活地调整行距、堆距和层数。以便易于通风散热，防治烧菌想象的出现。温度较高的月份尤其入夏后，行距要不少于30cm，堆距不少于7-10cm。
(2)、打孔“放大气”后的，棚温菌温管理很重要，一定要做好通风散热及降温工作，否则也会造成烧菌的。