1、适当改换菌种，优化菌株。香菇菌种众多，根据自己多年的实际种植情况，可以挑选同类菌种改良优化。
2、更换菌种的厂家和产地，提高菌株活力。如果不想换种，那么建议同一个菌种尽量更换产地和厂家。因为每个地区的环境有所差异，每个厂家的基料配比也存在不同，在PH值和其他物理指标产生微变时能增强菌株的活力。
3、发菌棚和出菇棚必须进行严格的消毒杀菌，消灭一切杂菌源，菌棒进入发菌棚前，很多菇农会用烟剂进行杀菌，这是非常正确，也是非常有必要的，烟剂覆盖的区域比较广，一些狭小空隙的杂菌都会被杀灭，但是大家却忽视了地面和地下，烟是向上运动，所以对地面和地下的杂菌难以清除，而地面又是杂菌最多的地方，因为所有的杂菌会随着我们日常的注水，喷水流入地下，并越积累越多，而新菌棒进入到发菌棚后，就会带来感染的风险，因此每年菌棒进入到发菌棚和出菇棚前后，最好对地面喷洒一遍杀菌药。