臭氧以其特有的气味而得名，它是一种气体强氧化剂，具有杀菌力强，不产生任何残留污染，可直接对食用菌物料，接菌工具，接菌，菌房培养，大棚催芽使用的优点。作为一种广谱高效杀菌剂，其杀菌速度较氯快300-600倍，可以快速杀灭各种细菌繁殖体和芽孢，病毒和真菌，如；寄生性真菌病害：有褐腐病、褐斑病、软腐病、褶霉病、枯萎病、浅红酵母病等。竞争性真菌病害：毛霉，根霉，曲霉，青霉，链孢霉，绿霉。特别是对黑木耳栽培菌制菌期危害最为严重的“红色脉孢霉（Neurosporspp）”杀菌效果极佳。在传统杀菌药物中如；甲醛 又名福尔马林，高锰酸钾 俗名灰锰氧，酒精 化学名称乙醇，多菌灵 又称棉萎灵，气雾消毒盒 商品为灰色粉剂，新洁尔灭 阳离子型表面活性杀菌剂，升汞 重金属盐型杀菌剂，碘福 广谱性杀菌剂，百菌清 有机氯保护性广谱杀菌剂，硫磺 保护性杀菌剂和杀螨剂。杀菌不彻底有死角，药物残留大可造成二次污染，对人有伤害，多年用的菌房内各种细菌形成了对药物的抗性不易杀死。随着人们对化学消毒剂在制菌中对生产人员造成的伤害和化学消毒剂残留造成黑木耳污染的重视。臭氧将成为食用菌行业的新兴消毒剂得到迅速的推广和使用。

食用菌培养室与制菌工具的消毒灭菌
在食用菌厂，臭氧气体用于食用菌培养室，接菌室食用菌培养室，接菌室与制菌工具与制菌工具消毒是非常方便，有效的传统的消毒方法是用甲醛，硫磺等化学试剂熏蒸，众所周知，甲醛，硫磺熏蒸的弊病较多，国外近期研究证明，在控制空气微生物方面，臭氧是甲醛和其它化学熏剂的替代物。通过化学雾化，紫外线与臭氧作消毒剂的对照试验，结论是臭氧既有效又无残留，臭氧“大大抑制” 食用菌培养室，接菌室与制菌工具中各种细菌群体的生长。
其方法是；（1）将臭氧发生器直接放在食用菌培养室，接菌室入门口上方或放在离地面2m-2.5m的地方加以固定，对洁净区进行消毒灭菌（2）大的食用菌厂可以将臭氧发生器放在食用菌培养室，接菌室的外面，通过管道将臭氧打入各输入口中，然后被送入各洁净区，或采用台式自带风机臭氧发生器，多点设计将臭氧散布在洁净区内，统称为外置式臭氧发生器，外置式臭氧发生器安装检修方便。（3）采用臭氧发生器连接导气管和曝气系统，在食用菌培养室，接菌室，黑木耳深加工厂顶部布设曝气管网，将臭氧送入洁净区。特别是在食用菌生产前把各菌房用臭氧提前杀菌消毒。几种方法消毒效果都是一样的。从使用臭氧进行灭菌的食用菌厂的检测报告可看到，菌检全部合格，完全替代了令人头痛的甲醛，硫磺熏蒸大消毒同时，能耗减少，人身健康，取得了满意效果。